KO(Knockout)와 KD(knockdown)

KO :  knockout; amorphic 또는 null mutation

-> 크리스퍼 (CRISPR)

  크리스퍼(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR))는 가이드 RNA(guide RNA)와 카스9 단백질(Cas9 protein)을 이용하는 유전자 조작 방법이다. 가이드 RNA는 원하는 DNA시퀀스의 단순히 상보 가닥을 만드는 것으로 가능하다. 이는 아연집게(zinc-fingers)나 탈렌(TALENs)의 경우에서 시간이 많이 걸리는 것과는 대조된다. 쌍을 이룬 카스9 단백질은 DNA에서 이중가닥을 풀어낼것이다. 아연집게나 탈렌에서와 마찬가지 원리로, 이중가닥이 풀린것을 수리하는 과정에서 생기는 프레임시프트 돌연변이는 비기능성 유전자를 만들어 내게 된다.

 

KD : knockdown; 유전자의 기능을 '감소'시킴. (reduced) mutant

-> gene silencing을 통해 protein KD 시키는 방식 ; shRNA & siRNA 이용

-> RNA interference (RNAi) using dsRNA ~ mRNA의 degradation 유도

https://www.labome.com/method/siRNAs-and-shRNAs-Tools-for-Protein-Knockdown-by-Gene-Silencing.html#:~:text=Through%20the%20activity%20of%20several,its%20levels%2C%20and%20eventual%20knockdown.

siRNAs and shRNAs: Tools for Protein Knockdown by Gene Silencing